Pondok Pesanren Gedangan mempunyai gedung
madrasah yang merupakan sentral dari segala kegiatan santri, baik berfungsi
sebagai tempat kegiatan belajar mengajar, maupun segala kegiatan lainnya.
Pengasuh membangun gedung madrasah bertujuan untuk mencerdaskan dan membina
santrinya dalam bidang keagamaan dan bidang keilmuan umum lainnya. Diharapkan
dengan sarana ini pesantren dapat menghasilkan lulusan yang berkualitas, baik
IMTAQ maupun IPTEK nya, sehingga menjadi SDM yang dapat bersaing dengan
madrasah lain.